Post by alamin447 on Aug 2, 2023 1:04:15 GMT -5
误距离1（d1）测序读数，揭示了交联mRNA和前mRNA片段的有效恢复，这些读数携带所有主要器官（包括脑、肺、肾脏和睾丸）的特征性T到C转换（补充图1j，补充 表1 ）。TIAL1 与其靶标的交联读数分布在多个器官中是相似的（图 1f）。该方法对于肝脏和脂肪组织中的另一种测试的 RBP (HuR) 也可
重现（补充图 1h，k）。综上所述，viP-CLIP 方案（补充亚洲手机号码列表方法）是对传统 CLIP 方案的有用扩展，能够以高重现性从完整小鼠器官中识别交联 RNA 靶标，从而能够深入研究遗传小鼠中的 RBP-RNA 相互作用模型和不同的环境条件下（详细的分步协议可在协议交换（）中找到。 小鼠肝脏中的肝脏 Tial1 viP-CLIP 揭示了参与脂来的目标是使用 viP-CLIP 识别肝脏中内源性和过表达
TIAL1 的 RNA 靶标。TIAL1 过表达是通过注射表达表位标记的 Tial1 (Ad-Tial1) 的重组腺病毒来实现的，导致 TIAL1 蛋白表达增加约 2.5 倍（补充图 2a ）。对三只小鼠进行 viP-CLIP，每只小鼠使用识别内源性 TIAL1 蛋白的抗体或感染表达标记 TIAL1 蛋白 (Ad-Tial1) 的重组腺病毒的小鼠的抗 myc 抗体。我们获得了内源性 TIAL1 的1.3×10